Чтобы обновить Drupal в рамках одной мажорной версии, нужно проделать следующее:

  1. Скачиваем последнюю стабильную версию.
  2. Бэкапим БД и папку с друпалом.
  3. Логинимся на сайте под админом, не закрываем окно браузера.
  4. Выключаем сайт ( admin/config/development/maintenance).
  5. Заливаем новую версию друпала поверх старой.
  6. Запускаем мастер обновления http://example.com/update.php
  7. Включаем сайт.

Файл install.php удалять не нужно.

Подробнее про обновление можно почитать в файле UPGRADE.txt, в корне друпала.